Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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