Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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