Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EP300Q09472 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EP300Q09472 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EP300Q09472 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EP300Q09472 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EP300Q09472 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms