Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCBP1Q09161 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCBP1Q09161 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms