Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C2orf54Q08AI8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf54Q08AI8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms