Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LTBQ06643 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBQ06643 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms