Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms