Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BNC1Q01954 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms