Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms