Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK16Q00536 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms