Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIP4K2BP78356 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms