Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EMP1P54849 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EMP1P54849 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EMP1P54849 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EMP1P54849 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EMP1P54849 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EMP1P54849 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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