Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA3P52797 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms