Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX2P50458 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms