Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTPAP49638 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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