Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms