Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDKN1BP46527 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms