Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms