Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms