Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC13P31276 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms