Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP1P29466 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP1P29466 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms