Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL4A5P29400 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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