Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRMP28827 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
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