Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms