Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms