Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms