Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRGP23470 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
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