Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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