Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF3P17036 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF3P17036 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms