Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB1P11230 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms