Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCF2P10911 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms