Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms