Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms