Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms