Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1RP07333 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms