Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCG5P05408 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCG5P05408 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCG5P05408 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms