Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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