Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3BO95985 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms