Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms