Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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