Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EEDO75530 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEDO75530 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEDO75530 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EEDO75530 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EEDO75530 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EEDO75530 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEDO75530 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms