Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18L1O75177 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms