Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms