Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPLO60437 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPLO60437 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPLO60437 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPLO60437 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPLO60437 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPLO60437 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms