Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms