Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EDIL3O43854 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EDIL3O43854 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms