Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCEO43556 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCEO43556 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCEO43556 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCEO43556 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCEO43556 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCEO43556 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCEO43556 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCEO43556 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCEO43556 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCEO43556 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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