Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms