Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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