Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms